Преподобный Даниил Шужгорский родился в Московской земле в XVI веке. Он подвизался на севере Руси, где принял постриг в Комельском монастыре, основанном преподобным Корнилием Комельским в 1498 году.

Устав, данный монастырю преподобным Корнилием (память его 19 мая), предписывал инокам со страхом Божиим пребывать в молитве, заботиться о внутреннем делании, бодрствовать душою, сокрушаться сердцем и отгонять от себя все земные помыслы.

Преподобный Даниил покинул монастырь и продолжил уединенную подвижническую жизнь в безлюдной и лесистой местности в 50-ти верстах от Белозерска, на горе, именовавшейся Шужгорой (Новгородская земля, ныне Вологодская область и епархия).

Здесь святой подвижник основал свой монастырь в честь Преображения Господня.

В 1764 г. монастырь был обращен в приход.
 
В каменной церкви Преображения Господня, бывшей монастырской, ныне приходской, почивают под спудом мощи преподобного Даниила Шужгорского.